Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprdQ64487 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms