Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms