Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp2Q61990 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms