Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hes3Q61657 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hes3Q61657 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hes3Q61657 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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