Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sox17Q61473 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox17Q61473 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox17Q61473 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sox17Q61473 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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