Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms