Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usf1Q61069 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usf1Q61069 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usf1Q61069 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usf1Q61069 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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