Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd4Q60688 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms