Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PtprnQ60673 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PtprnQ60673 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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PtprnQ60673 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PtprnQ60673 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprnQ60673 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PtprnQ60673 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms