Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms