Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms