Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmtk3Q5XJV6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmtk3Q5XJV6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms