Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf15Q5UBV8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms