Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Repin1Q5U4E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Repin1Q5U4E2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms