Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms