Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh12Q5RJH3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms