Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJG7

Ispd, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IspdQ5RJG7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IspdQ5RJG7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IspdQ5RJG7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IspdQ5RJG7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IspdQ5RJG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms