Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trdv4Q5R1A3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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