Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf488Q5HZG9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf488Q5HZG9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms