Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms