Protein–RNA interactions for Protein: Q571G4

Lin54, Protein lin-54 homolog, mousemouse

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin54Q571G4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin54Q571G4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin54Q571G4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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