Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otol1Q4ZJM7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otol1Q4ZJM7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms