Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms