Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Prdm6Q3UZD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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