Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms