Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn4Q3UWL8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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