Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga4Q3UW12 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms