Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms