Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms