Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ell2Q3UKU1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms