Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc177Q3UHB8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc177Q3UHB8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms