Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms