Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms