Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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