Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms