Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms