Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms