Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5b1Q3TAP4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5b1Q3TAP4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms