Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riiad1Q3KNY5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms