Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms