Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd11Q1RNF8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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