Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd300lgQ1ERP8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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