Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ttc39dQ0VF76 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc39dQ0VF76 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms