Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms