Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc7a1Q09143 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc7a1Q09143 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms