Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn1Q08091 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms