Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms