Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms