Protein–RNA interactions for Protein: Q07174

Map3k8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k8Q07174 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Map3k8Q07174 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Map3k8Q07174 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Map3k8Q07174 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Map3k8Q07174 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Map3k8Q07174 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms