Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah2Q06986 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah2Q06986 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms